Jesteśmy jednostką kultury prowadzącą działalność z zakresu muzealnictwa, zwolnioną z VAT, i działalność opodatkowaną – głównie z tytułu sprzedaży biletów wstępu, sprzedaży wydawnictw itp. Jesteśmy czynnym podatnikiem VAT rozliczającym podatek proporcją. Jak prawidłowo rozliczać VAT naliczony z faktur dotyczących ulepszenia środka trwałego (przebudowy nieużytkowego poddasza z przeznaczeniem na galerie wystawiennicze), finansowanego ze środków Unii Europejskiej w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego. VAT został uznany (na podstawie mylnej interpretacji przepisów) za koszt kwalifikowany. Zgodnie z otrzymaną z Ministerstwa Finansów interpretacją VAT będzie podlegał odliczeniu na podstawie proporcji i zwrotowi do instytucji zarządzającej RPO. Zakończenie prac jest przewidziane na rok 2011. Koszty prowadzonej inwestycji będą zwiększać wartość nieruchomości podlegającej amortyzacji. Odzyskany VAT będzie podlegał zwrotowi dotującemu. Zakończona inwestycja, polegająca na przebudowie poddasza, będzie wykorzystywana do wykonywania zarówno czynności, w związku z którymi będzie przysługiwało prawo do obniżenia podatku należnego, jak i czynności, w związku z którymi takie prawo nie przysługuje.